Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alkbh4Q9D8F1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms