Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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