Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Jam3Q9D8B7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms