Protein–RNA interactions for Protein: Q9D832

Dnajb4, DnaJ homolog subfamily B member 4, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb4Q9D832 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dnajb4Q9D832 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dnajb4Q9D832 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms