Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Tmem54Q9D7S1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Tmem54Q9D7S1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms