Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmigd1Q9D7L8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmigd1Q9D7L8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms