Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfsf13Q9D777 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfsf13Q9D777 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms