Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Rab11fip1Q9D620 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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Rab11fip1Q9D620 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Rab11fip1Q9D620 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab11fip1Q9D620 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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Rab11fip1Q9D620 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rab11fip1Q9D620 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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