Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W6

Slco6d1, MCG6225, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco6d1Q9D5W6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slco6d1Q9D5W6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slco6d1Q9D5W6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms