Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q9D5Q8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q9D5Q8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms