Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Speer4f1Q9D5Q6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms