Protein–RNA interactions for Protein: Q9D552

Spata17, Spermatogenesis-associated protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata17Q9D552 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Spata17Q9D552 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Spata17Q9D552 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms