Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc7Q9D541 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc7Q9D541 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms