Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc130Q9D516 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc130Q9D516 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms