Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tomm20lQ9D4V6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms