Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
4930578G10RikQ9D4Q4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
4930578G10RikQ9D4Q4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms