Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gcc1Q9D4H2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gcc1Q9D4H2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms