Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
4933428M09RikQ9D3X3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
4933428M09RikQ9D3X3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms