Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W4

Gpn3, GPN-loop GTPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpn3Q9D3W4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpn3Q9D3W4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gpn3Q9D3W4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms