Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph14Q9D3W1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph14Q9D3W1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms