Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3N5

5430402E10Rik, RIKEN cDNA 5430402E10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430402E10RikQ9D3N5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
5430402E10RikQ9D3N5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430402E10RikQ9D3N5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms