Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Vsig1Q9D2J4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Vsig1Q9D2J4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms