Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Nol3Q9D1X0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nol3Q9D1X0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms