Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1R9

Rpl34, 60S ribosomal protein L34, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl34Q9D1R9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl34Q9D1R9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl34Q9D1R9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms