Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chordc1Q9D1P4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chordc1Q9D1P4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms