Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SarnpQ9D1J3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SarnpQ9D1J3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms