Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q9D1F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q9D1F3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms