Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lmbr1lQ9D1E5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmbr1lQ9D1E5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms