Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ss18l2Q9D174 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18l2Q9D174 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms