Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkain1Q9D035 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms