Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3bQ9CZT8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab3bQ9CZT8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms