Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZD5

Mtif3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtif3Q9CZD5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Mtif3Q9CZD5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms