Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssu72Q9CY97 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssu72Q9CY97 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms