Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exo5Q9CXP9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.1 ms