Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Q9CXL3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9CXL3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms