Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX86

Hnrnpa0, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnrnpa0Q9CX86 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hnrnpa0Q9CX86 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hnrnpa0Q9CX86 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms