Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Psmd8Q9CX56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms