Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Utp23Q9CX11 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms