Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxxc1Q9CWW7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxxc1Q9CWW7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms