Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Malsu1Q9CWV0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Malsu1Q9CWV0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms