Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nup37Q9CWU9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nup37Q9CWU9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms