Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q9CWU4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Q9CWU4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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