Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tdrd12Q9CWU0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tdrd12Q9CWU0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms