Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx10Q9CWT3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx10Q9CWT3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms