Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Otud1Q9CUB6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Otud1Q9CUB6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms