Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tma16Q9CR02 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tma16Q9CR02 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms