Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ykt6Q9CQW1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms