Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PompQ9CQT5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PompQ9CQT5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms