Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atp5f1Q9CQQ7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms