Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smim8Q9CQQ0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms